هناك 4 أنواع من فيروسات الإنفلونزا الموسمية، وهي الأنواع (A) و(B) و(C) و(D). ويُعد فيروسا الإنفلونزا (A) و(B) الأكثر شيوعًا ويتسببان في أوبئة أمراض موسمية على الصعيد العالمي. وفي المناطق المعتدلة، تسبب كل من الإنفلونزا (A) و(B) أوبئة شتوية، حيث تتسبب في حالات متفرقة وفاشيات في غير موسمها. وفي المناطق المدارية مثل إقليم شرق المتوسط يتراوح انتشار فيروسات الإنفلونزا ما بين ذروة موسمية في الفترة من تشرين الأول/أكتوبر إلى أيار/مايو، وحالات محدودة الانتشار على مدار العام.
وتُصنَّف أيضاً فيروسات الإنفلونزا (A) إلى أنواع فرعية حسب توليفات الهيماغلوتينين (الراصَّة الدموية) والنُورامينيداز، وهما بروتينان موجودان على سطح الفيروس. وينتشر بين البشر حاليًا النوعان الفرعيان A(H1N1) وA(H3N2) من فيروسات الإنفلونزا. ويُشار أيضاً إلى فيروس A(H1N1) باسم A(H1N1)pdm09 لأنه تسبَّب في الجائحة التي وقعت في عام 2009 وحلّ فيما بعد محل فيروس الإنفلونزا الموسمية A(H1N1) الذي كان منتشرًا قبل عام 2009. ومن المعلوم أن فيروسات الإنفلونزا من النوع (A) فقط هي التي تسببت في حدوث جوائح.
ولا تُصنَّف فيروسات الإنفلونزا (B) إلى أنواع فرعية، ولكن يمكن تقسيمها إلى سلالات. وتنتمي فيروسات الإنفلونزا من النوع (B) المنتشرة حاليًا إما إلى سلالة (B/Yamagata) وإما إلى سلالة (B/Victoria).
وقلَّما يُكتشَف فيروس الإنفلونزا (C)، وعادةً ما يتسبب في حالات عدوى خفيفة، ولذلك لا يمثل أهمية فيما يخص الصحة العامة.
أما فيروسات الإنفلونزا (D) فتصيب الماشية في المقام الأول، ولا يُعرَف عنها أنها تصيب البشر أو تُمرِضهم.