الهدف من برنامج معالجة نفايات الرعاية الصحية والنفايات الخطرة هو الحد من العبء البيئي للمرض في مواقع الرعاية الصحية وجعل القطاع الصحي أكثر امتثالاً لصداقة البيئة. وتتضمن أنشطة البرنامج ما يلي:

تقييم الصحة البيئية في مواقع الرعاية الصحية

تطوير الدلائل الإرشادية والوثائق الاستراتيجية

تنظيم دورات تدريبية حول الصحة البيئية في مرافق الرعاية الصحية

إجراء مشاريع تجريبية

أنشطة البرنامج للتخفيف من عبء المرض عن طريق المعالجة المناسبة لنفايات الرعاية الصحية في البلدان، وتتضمن ما يلي:

• تقييم عبء الأمراض المرتبطة بأدوات الحقن وتطبيق ممارسات آمنة لإدارة النفايات (باكستان)  
• القيام بأنشطة تدريبية حول معالجة نفايات الرعاية الصحية مع التركيز على نحو خاص على النفايات الحادة وأدوات الحقن (أفغانستان وجيبوتي وباكستان)
• إعداد وثيقة إرشادية عن الصحة البيئية في مواقع الرعاية الصحية مع التركيز على نحو خاص على معالجة نفايات الرعاية الصحية (السودان)
• إعداد خطط حول معالجة نفايات الرعاية الصحية (اليمن).

يعمل البرنامج أيضاً مع المجتمعات لبناء قدراتها في مجال معالجة النفايات والقضايا ذات الصلة بالنظافة الصحية. وقد تم الترويج لمعالجة النفايات الصلبة المرتكزة على المجتمع ومشاريع النظافة الصحية المرتبطة بها في المغرب والصومال وجنوب السودان والسودان واليمن.